Po pokonaniu Bowsera i uratowaniu Brooklynu Mario staje przed nowym zagrożeniem: złowrogim sojuszem Wario i Bowsera Jr. Teraz, wraz z przyjaciółmi i Yoshim u boku, musi powstrzymać ich plany podboju świata.
19-letnia miłośniczka zwierząt wykorzystuje technologię, która pozwala przenieść jej świadomość do ciała robotycznego bobra, by odkrywać tajemnice świata natury.
Po opuszczeniu więzienia kobieta usiłuje odbudować relację z córką. Wsparcia udziela jedynie właściciel baru, a konfrontacja z dawnymi błędami staje się nieunikniona.